据突厥习俗，可汗正妻在部族中有绝大威势，且可参与军政大事。义成公主既为四任可汗正妻，在突厥权势尤其高炽。
颉利可汗拗不过义成公主，只得罢议和亲，再行征战。由是联合燕王高开道，请其制作攻城器具，合力围攻马邑。
又过十数日，马邑城中粮食吃尽，高满政只好打算弃城而走。
便在此时，马邑城中却忽生变乱。武德六年十月二十日，唐将右虞侯杜士远于杀死主将高满政，率兵献出马邑城门，投降突厥颉利可汗。
苑君璋进入马邑城内，大加报复，杀死高满政部下三十余人，并其家人妻子，一个不留。
凶信传至长安，唐高祖悲悯良久，为其辍朝一日，复拜其子高玄积为上柱国，命承袭父亲官爵。十月二十五日，颉利可汗与唐朝议和，将马邑归还唐朝。
唐高祖李渊任命秦武通为朔州总管，驻屯马邑。
苑君璋部下都是中原人，厌恶此等内讧不已，又多年来疲于奔命，半数死于征杀，于是大多脱离，转而投奔唐军。
苑君璋恐惧非常，恐再遭内乱，便遣使向唐军主动投诚，请防守北边赎罪。
李高迁报与朝廷，唐高祖允诺，并遣雁门人元普为使，话符前言，送其免死铁券。
未料便在此时，恰遇突厥颉利可汗派人前来招降，苑君璋复又犹豫不决。其子苑孝政谏道：父亲既答应降于唐朝，又要贰于颉利可汗，是自取灭亡也。今粮食殆尽，人心又离，若不及时决断，恐再发生意外变故，儿孝政不忍见此惨祸！
因见父亲不应，随即单骑南奔。苑君璋急使人追回，然后召集众人商议。
恒安人郭子威进言：恒安地势险要，城墙坚固，足以驻军屯兵。且突厥正当强盛无比，主动为我依靠，将军居此以观天下风色可也，何必束手受制于人？
苑君璋赞同其议，遂将唐使元普送到突厥。
颉利可汗感其诚义，送以锦裘羊马，以作慰劳。
苑君璋进驻恒安，筹备再攻马邑，与唐朝对抗到底。部下由此大怨，争投恐吓信于行辕门内，并传语众军：若不早日降唐，必将苑氏父子诛灭。
苑孝政害怕至极，复欲策马出城投降唐朝，却被苑君璋拘禁，不得自由。其后苑君璋每与突厥入寇马邑，进犯太原，使边民吃尽苦头。
镜头转换，按下马邑，复说长安。
突厥频繁骚扰北疆，唐朝常年派兵防御作战，军粮耗费严重，边地人民不胜其荷。
有鉴于此，并州大总管府长史窦静上奏朝廷，力陈形势，请在并州屯田，以节省馈运。许多朝臣认为屯田麻烦，表示反对，窦静据理力争。
最终高祖采纳窦静意见，在并州地区实行屯田。其后每年收入谷物可达数千斛，足支军用。李渊大喜，擢拔窦静为检校并州大总管。
秦王李世民闻说窦静屯田大见成效，亦上疏奏请，在并州境内推广经验，增置屯田。
武德六年六月，瓜州（今甘肃酒泉）总管贺若怀广率部到达沙州（敦煌西），正遇沙州人张护、李通起兵反唐。贺若怀广率随从数百人退保子城，被张护等重重围困。
凉州总管杨恭仁闻报，派兵前去援救，却被张护等人打败。张护进围子城，杀死贺若怀广，拥立汝州别驾窦伏明为主，复率兵围攻瓜州。
瓜州长史赵孝伦组织人马奋力以抗，将其击退，并乘胜反攻沙州。
是年九月，窦伏明以沙州降唐。此为唐初一路反贼，不属隋末反王烟尘，故此不曾录于正史，后世大都不传其名，按下不提。
此后不久，唐廷派安抚使李大亮前往洪州，镇压张善安所部盗匪。
李大亮引军来至洪州，隔赣水布阵，与张善安遥相对话。因见其意动，遂单骑过河，到达张善安兵营，与其携手揽腕共语，以示彼此无猜。
武德六年十二月，张善安只率数十名亲兵，到李大亮营中回访。唐军将张善安亲兵挡在门外，只请其一人独进。张善安兀自不疑，坦然直入中军。
李大亮设宴以待，就说往年之事，欢若平生。
酒过三巡，张善安说道：善安当初既然降唐，便无反叛之意。怎奈被部下将士所误，重新沦落绿林，悔之莫及。今欲率部归降，又恐天子不能免罪。
李大亮说道：张总管既有归降之意，则与我便是一家人也。弟必于帝前全力遮护，以全家性命担保贤兄无罪。
张善安称谢不已，然而神色间毕竟不愉，似怀隐忧。
李大亮恐生反复，便生一计，暗遣心腹出帐，对张善安随从道：汝等还不速逃，更待何时？张善安因与我家元帅口角相争，今被拘帐中，既将开刀问斩矣！
众随从闻之，急上马回归大营，报说主将被李大亮扣留。诸将大愤，便皆争嚷，欲集全军出动，准备渡河攻打唐营，解救张善安。
便在此时，李大亮使者忽至，宣布张善