只要‘程序’正常运转，宇宙就不会出变故，就将会继续成长，直到极其遥远的未来走向衰败灭亡。
然而变数不在‘程序’的意料之内，但是还是出现了，那就是袁暮所熟悉的‘b’，也是严重危害到‘程序’运转的漏洞。
地球时间，八万年前，西方苏美尔文明繁华昌盛，遥远的东方尚在洪荒乱世中，一个自盘部落诞生名为古的青年，无意间察觉到宇宙的真相，而后奇遇不断，得到了一件‘b’具现化的奇物而实力大增，从此脱离了程序的束缚。
然而超脱不在‘程序’的许可之内，所以效忠于‘程序’的超强势力‘公司’把盘古视为眼中钉肉中刺，势要把他扼杀在成长之初。
盘古忍辱偷生，为了保存最后一丝希望的火种，躲在暗处评价那件奇物壮大自身，直到迈入超脱，连‘程序’也无法再把控他的命运。
超脱后的盘古不忍族人世代生活在程序构建固定的人生轨迹，故而走上一条逆天之路，苦心积虑，积累力量，拉拢志同道合的伙伴，帮助其脱离程序之束缚，游走在无数位面之间，最终发起宇宙革命-开天战役，以人类之身，向浩瀚无垠的宇宙发出怒喝，重创了程序，为后世之人超脱保留了一丝希望。
苏美尔文明极度发达，早在盘古超脱之前就已经隐约触碰到真相的边缘，可惜由于其族人自高自大，不思进取，不愿与出身低微的东方势力合作，最终无法超脱，湮灭于历史洪流之中。
盘古开天，悍志长存！
虽然无法彻底打破轮回，但是盘古身死前，早已在各位面留下伏笔，待时机成熟，后世有缘人自可再次发动开天战役，彻底为人族挣脱天地束缚，到达彼岸，其最终手段名为……逆！
凡是对抗程序者，将会遭到天地的恶意，经历常人无法想象的恐怖危险，一切只存在噩梦中的事宜，将会具现化，逆天之路何其渺茫。
而那件被盘古意外得到的‘b’具现化之物也被称之为‘系统’！
……
得知惊天秘闻后，袁暮顺利回归现实，莫飞云和韩佳妍早已回归。
不过莫飞云的背叛让袁暮难以接受，哪怕他有不得已为之的苦衷也一样，从此两人分道扬镳。
而重生的陆谨超针对袁暮的布局也在悄然展开，可惜他低估了袁暮的成长速度，也高估了自己的实力，导致被袁暮再杀一次，形神俱灭，完全失去重生的可能性。
经此一役后，袁暮心知‘公司’很可能已经察觉到他的存在，疯狂地在现实与异界之中冒险。
在冒险中，袁暮发现陈耀斌的痕迹越来越明显，同时也逐渐与‘公司’势力的‘程序员’发生冲突，一次捣毁‘公司’程序维护员外位面分部的战斗中，得到明确的情报，得知陈耀斌被禁锢在神秘莫测的程序回收站中。袁暮不顾伙伴劝阻，勇闯危险至极的回收站，最终成功救回陈耀斌，两人一番开诚布公地交谈，掀起了历史迷雾的重要一页。
而后袁暮在陈耀斌协助下，终于晋级到使用者最强的统领级使用者。
陈耀斌把收集到关于世界真实性，以及开天战役的情报告诉袁暮，同时也透露出一个惊为天人的重大秘密，袁雅的人间蒸发大有文章。
袁暮不愿意深究陈耀斌的猜测，两人关系再度陷入胶着，只是在强大的‘公司’威胁下，两人最后还是放下矛盾，联手对抗系统。
袁暮身为统领级使用者，本身有权限组建工会，系统颁发一个有史以来从未有过的五级悬殊任务，要求所有的工会共同前往宇宙负位面——深渊中搜捕最后一条龙。
超过八十个工会齐聚一堂，共赴深渊，‘公司’也排出超过近百个工作组进入深渊，其中领头人乃是号称宇宙最强者的齐天级强者零号。
工会与工作组爆发惊天大战，袁暮血战零号，最终还是不敌实力逆天的零号，被打入深渊。
就在袁暮以为再无幸存之理时，久违的袁雅出现，把袁暮救出水深火热之中。
两姐弟再度重逢，气氛却非常微妙。
袁雅坦然地道出真相，袁暮所遭遇的一切，都是她一手促成的，只因为袁暮是应许之人，天生可免疫程序的控制，目的是为了再度重启开天战役，袁暮所以的记忆全都是袁雅一手篡改的。
袁暮得知真相，一直以来坚持的信仰瞬间崩塌。
五级悬殊任务最后以系统势力惨败告终，‘公司’得到最后之龙，抽取其携带的大量奇点，几乎补全了当初开天战役中被盘古重创的伤势，系统势力遭到毁灭性打击。
袁暮心丧若死，不愿面对残酷的现实，自我封闭起来。
袁雅接过系统大旗，率领残部且战且退，艰难地与程序抗衡。
最后的大逃亡中，袁雅与陈耀斌以自我牺牲的代价，